隨著公眾對健康問題關注度和認知度的提高，特別是近年來受到公眾批評的食品安全衛生問題，安全狀況令人擔憂。為了更好地控制食品安全衛生問題，國家還出臺了相應的法律法規，監督、約束、杜絕和懲治《食品安全衛生法》的違法行為，并對相關食品生產經營企業提出了良好的凈化車間生產規范要求。
為了使食品生產全過程不受微生物污染，容易變質，應處理原材料、水、設備等。凈化車間環境是否清潔也是一個重要條件。此外，一些食品需要清潔無菌的凈化車間生產環境，如以下行業。
奶制品
酸奶、無菌牛奶或奶酪的加工以及瑞典香腸包裝中經常使用的無菌處理。一些大型設施需要1萬級以上（ISO8級和9級）。
灌裝(酒、飲料等)
啤酒、果汁和汽水無菌填充工藝增加了ISO5級(100級)和ISO6級(1000級)潔凈室。
在傳統系統中，隧道巴氏殺菌法對產品進行各種高溫處理，產品的物理特性發生了變化。相比之下，受控巴氏殺菌法的無菌充裝采用低熱處理，可以在幾個方面提高產品質量。
凈化車間生產的食品，由于清潔度高，可以保證食品不被細菌附著，但不能消除食品本身帶來的細菌，因此需要加熱、噴灑、照射等滅菌方法。許多食品潔凈室主要用于滅菌后的冷卻、切割（片）、包裝等過程。
